L’ensemble de la végétation aquatique, microphyte et macrophyte (très petits et plus grands végétaux), constitue la flore de la rivière. Les microphytes sont essentiellement représentés par des algues unicellulaires ou filamenteuses de formes et de groupements extrêmement variés. Citons, parmi les dizaines et les dizaines d’espèces, le spirogyre, l’euglène, le scenedesmus, le closterium, etc. Les diatomées, algues brunes, sont aussi présentes et leur indice matérialise le bon état de l’eau.Les macrophytes peuplent le lit de la rivière. On trouve des élodées, très productrices d’oxygène, et des myriophylles dont la chevelure ondule au gré du courant.Nous n’oublierons pas la ripisylve, végétation des bords de l’eau, dont font partie les aulnes et les saules. C’est là un petit échantillon parmi l’extraordinaire profusion d’espèces qui bordent nos rivières. Si on voulait poursuivre ce panorama de la flore des rivières, il nous faudrait également évoquer les bactéries, les virus, les cyanobactéries (algues bleues), etc.